样本创建于1937年，其前身是福建省立医学专科学校毕业证。1939年改名为福建省立医学院毕业证样本。1949年改称福建医学院毕业证样本。1969年，与福建中医学院毕业证样本、华侨大学毕业证样本医疗系合并，成立福建医科大学毕业证样本。1982年更名为福建医学院毕业证样本。1996年4月改为现名。
福建医科大学毕业证样本现有19个学院毕业证样本、部，即基础医学院毕业证样本、口腔医学院毕业证样本、公共卫生学院毕业证样本、药学院毕业证样本、护理学院毕业证样本、医学技术与工程学院毕业证样本、人文学院毕业证样本、研究生学院毕业证样本、海外教育学院毕业证样本、成人教育学院毕业证样本、职业技术学院毕业证样本、继续教育学院毕业证样本、第一临床医学院毕业证样本、第二临床医学院毕业证样本、协和临床医学院毕业证样本、省立临床医学院毕业证样本、福总临床医学院毕业证样本、海峡学院毕业证样本、和体育教研部；23个本科专业（方向），即临床医学（本硕连读）、临床医学、临床医学（临床病理学专业方向）、临床医学（急救医学专业方向）、临床医学(眼与视光学专业方向)、口腔医学、医学检验、麻醉学、医学影像学、康复治疗学、预防医学、预防医学(检验检疫专业方向)、预防医学(妇幼保健专业方向)、护理学、药学、药学(临床药学专业方向)、药学(药物分析专业方向)、药物制剂、应用心理学、英语、社会工作、公共事业管理(卫生管理专业方向)、公共事业管理(医院管理专业方向)；博士学位授权点22个，硕士学位授权点59个、专业硕士学位授权点2个。目前，各类在校生20000多人，其中本科生10000多人，博士、硕士生近2000人，本科专业面向全国20个省、直辖市、自治区和港澳台地区招生。
目前，学校有临床医学博士后科研流动站1个，科研机构65个，福建省“211”工程重点学科2个，省重点学科13个，省科技厅优先发展学科8个，学校重点学科6个，省医学重点专科6个，省领先医疗特色专业5个，省高校重点实验室3个，承担着大量的科研任务，成果显著。学校编辑出版的学术刊物《福建医科大学学报》、《福建医科大学学报（社科版）》、《中华高血压杂志》和《心血管康复医学杂志》等，面向国内外公开发行。学校图书馆面积25233平方米，图书、资料153万册，是福建省医学图书中心馆。
“十一五”期间，我校将以党的十七大精神为指导，推进学校毕业证新一轮发展，成为办学规模适度，学科结构合理，办学层次较高，整体实力较强；以普通本科教育为主，加快发展研究生教育和长学制医学教育；以医学为主，理学、管理学、法学等多学科协调发展的教学研究型省属重点医科大学毕业证样本，成为海峡西岸高级医药卫生人才主要培养基地、医学科学研究中心和医疗预防保健中心，跨入国内同类高校的先进行列。
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